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使用 Docker 部署 RStudio 的保姆级别教程,带你快速搭建一个Rstudio环境
不同版本的R包可能会引发兼容性问题。以Seurat包为例,V4和V5之间存在较大差异,而这些版本所依赖的其他R包也会对现有代码产生影响。如果你感兴趣,可以参考我的【Seuarat4和Seurat5 共存依赖解决方案】。另一种解决方案是使用Docker容器,通过其强隔离性来确保环境的一致性。今天,我将为大家介绍如何使用这种方法。
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R包安装教程,如何安装rjags和infercnv
R语言因其强大的统计分析能力和丰富的包生态系统,成为众多研究人员和数据科学家的首选工具。本文将详细介绍如何在R环境中安装两个重要的R包——rjags和infercnv。rjags用于与JAGS(Just Another Gibbs Sampler)进行接口,以执行贝叶斯统计分析;infercnv则用于推断拷贝数变异,广泛应用于单细胞RNA测序数据分析。以下内容将分步骤指导您完成这两个包的安装。
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如何安装monocle3,BiocManager::install("monocle3")问题解决
monocle3 是一个用于分析单细胞转录组数据的 R 包。它提供了强大的工具来进行细胞轨迹分析、细胞类型标注以及其他高级单细胞数据分析功能。下面是如何在你的系统中安装 monocle3 包的详细步骤
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安装install.packages("sf")报错解决办法.checking GDAL: checking whether PROJ
在 R 语言中,sf(simple features)包是处理地理空间数据的强大工具。如果你需要处理地理数据、进行空间分析或创建地图,sf 包无疑是一个非常有用的选择。本文将详细介绍如何在 R 环境中安装 sf 包,并简要介绍一些安装过程中的常见问题及解决方案。
作者还给咱们录制的视频版教程,基于西柚云生信服务器 Ubuntu系统20.04录制的。
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【生信圆桌x生信云服务器】如何解决 libstdc++.so.6 version `GLIBCXX_3.4.29‘ not found的问题
【生信圆桌x生信云服务器】如何解决 libstdc++.so.6 version `GLIBCXX_3.4.29‘ not found的问题
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R语言依赖包安装最详尽教程(R包安装包教包会)
【R包安装教程】不少生信的同学最头痛的就是安装R包了,版本不兼容依赖嵌套安装报错。还有不少同学只会 【install.packages("xxx")】这一种安装方式。导致大家在生物信息这个路上真可谓是如履薄冰。
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国内GitHub不稳定,443error: RPC failed; curl 28 Failed to connect to github.com port 443:
国内访问GitHub不稳定,git clone时常443error: RPC failed; curl 28 Failed to connect to github.com port 443: Connection timed out
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Rstudio Server常见问题处理手册
上面这个界面是不是非常熟悉?Rstudio 死亡圈圈一般发生在输入账号密码后进入Rstudio的时候,如果之前运行过大任务,有可能会出现这种情况。Rstudio常见问题我们如何排查和处理,本文章将给你一些思路和处理方式。
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DAP-Seq:解锁转录因子结合位点的新钥匙
在基因组学的浩瀚宇宙中,转录因子如同掌管基因表达的神秘钥匙。它们与DNA上的特定序列结合,调控着生命活动的每一个节拍。然而,传统的研究方法在探索这些结合位点时面临诸多挑战。今天,我们将一起了解一种创新技术——DAP-Seq,它如何突破限制,为我们揭示转录因子结合位点的秘密。
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【带你入门生信】什么是生物信息学?
生物信息学:利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学,对生物学数据进行搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及分析(计算和模拟),提取生物信息的学科。
把生物学问题转化为计算问题。