【带你入门生信】什么是生物信息学？

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生物信息学

生物信息学：利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学，对生物学数据进行搜索（收集和筛选）、处理（编辑、整理、管理和显示）及分析（计算和模拟），提取生物信息的学科。

把生物学问题转化为计算问题。

研究内容

中心法则视角

• DNA/基因组：序列比对与数据库搜索，物种基因组演化距离和 DNA 的甲基化等；

• RNA：序列比对与数据库搜索，样本间的差异化表达和共表达，以及非编码 RNA 等；

• 蛋白质：序列比对与数据库搜索，基于质谱的蛋白质鉴定，结构预测等；

• 分子网络：蛋白互作网络，转录调控网络，代谢和信号转导网络，网络间的动力学特征等；

• 细胞水平：虚拟细胞模拟等；

• 生理/病理现象：基于群体遗传学和人类遗传学的生理/病理学研究等。

数据视角

• 数据管理：数据库系统的建立，本体论与元数据等；

• 数据计算：算法与软件的设计，以及 Web 服务器的部署等；

• 数据挖掘：生物学发现；

• 建模与仿真：建立预测模型并模拟生物学系统等。