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生信学习好帮手——生信云,一种更[省心]的云服务器
生信云服务器为生物信息学学习者提供了强大的计算资源和灵活的学习环境，简化了复杂的分析流程，降低了学习成本，是生信学习的理想工具。生信云服务器, 生物信息学学习, 云计算, 数据分析, 学习资源, 计算能力
在 Docker 版 RStudio 中安装 Seurat V4 的完整教程 （同样适用于普通R环境安装）
在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析领域，Seurat 是一个广泛使用且功能强大的R包，提供了丰富的数据处理和可视化工具。为了简化环境配置和依赖管理，使用Docker来部署RStudio并安装Seurat V4是一种高效且可重复的方法。本文将详细介绍如何在Docker容器中部署RStudio，并在其中安装和配置Seurat V4包。
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使用 Docker 部署 RStudio 的保姆级别教程,带你快速搭建一个Rstudio环境
不同版本的R包可能会引发兼容性问题。以Seurat包为例，V4和V5之间存在较大差异，而这些版本所依赖的其他R包也会对现有代码产生影响。如果你感兴趣，可以参考我的【Seuarat4和Seurat5 共存依赖解决方案】。另一种解决方案是使用Docker容器，通过其强隔离性来确保环境的一致性。今天，我将为大家介绍如何使用这种方法。
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R包安装教程,如何安装rjags和infercnv
R语言因其强大的统计分析能力和丰富的包生态系统，成为众多研究人员和数据科学家的首选工具。本文将详细介绍如何在R环境中安装两个重要的R包——rjags和infercnv。rjags用于与JAGS（Just Another Gibbs Sampler）进行接口，以执行贝叶斯统计分析；infercnv则用于推断拷贝数变异，广泛应用于单细胞RNA测序数据分析。以下内容将分步骤指导您完成这两个包的安装。
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如何安装monocle3,BiocManager::install("monocle3")问题解决
monocle3 是一个用于分析单细胞转录组数据的 R 包。它提供了强大的工具来进行细胞轨迹分析、细胞类型标注以及其他高级单细胞数据分析功能。下面是如何在你的系统中安装 monocle3 包的详细步骤
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安装install.packages("sf")报错解决办法.checking GDAL: checking whether PROJ
在 R 语言中，sf（simple features）包是处理地理空间数据的强大工具。如果你需要处理地理数据、进行空间分析或创建地图，sf 包无疑是一个非常有用的选择。本文将详细介绍如何在 R 环境中安装 sf 包，并简要介绍一些安装过程中的常见问题及解决方案。
作者还给咱们录制的视频版教程，基于西柚云生信服务器 Ubuntu系统20.04录制的。
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如何在Linux下升级R版本和RStudio
在Linux上，R的安装通常通过包管理器完成。不同的Linux发行版（如Ubuntu、Debian、Fedora等）可能略有不同。下面以Ubuntu为例，介绍如何升级R版本。如果你使用其他发行版，步骤可能类似。
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生信人的好消息：Docker仓库被解禁了！
docker国内解封了！各位亲爱的生信小伙伴们，今天给大家带来了一个激动人心的好消息：Docker仓库在国内的访问限制已经解除了！这意味着我们可以像以前一样，自由地拉取和推送Docker镜像，不再受到任何限制。
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学生物信息：上千个R包环境都要自己安装？试试生信云服务器
作为一名生物信息学的学生或初学者，你可能会遇到这样的情况：为了完成一个分析任务，需要安装大量的R包和工具。对于初学者来说，如何快速搭建自己的工作环境成为了一个头痛的问题。那么，面对成百上千的R包，真的需要自己手动一个一个安装吗？答案是：未必。今天我们来聊聊生信云服务器的便利性，或许能帮你省下不少时间和精力。
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西柚云 Rstudio Server 使用教程
Rstudio与R语言的关系就像汽车和引擎一样，两者相得益彰不可分割。在日常使用过程中，需要在Rstudio中进行代码边写、调试、运行，一般情况下这个过程是在自己的笔记本电脑完成的。
